היועץ המשפטי לממשלה מייעץ לממשלה בענייני משפט ועומד בראש מערכת התביעה הציבורית. המשרד מייצג גם את האינטרס הציבורי בעניינים משפטיים ומנחה את מערך הייעוץ המשפטי לממשלה. במבנה המשולב הזה נתונים הייעוץ המשפטי והתביעה הפלילית בידי סמכות משפטית בכירה אחת.
ייעוץ לממשלה
היועץ המשפטי לממשלה מייעץ לקבינט ולמשרדי הממשלה אם פעולות מתוכננות עומדות בדרישות החוק, והמערך המשפטי שלו תומך בעבודת הממשלה ובחקיקה. יועצים משפטיים בממשלה מסייעים גם למשרדים ליישם מדיניות כחוק. משרד המשפטים מתאר את תפקידו ככולל ייעוץ משפטי לממשלה ולמשרדי הממשלה, לצד פרקליטות המדינה ואכיפת הדין הפלילי.
היועץ המשפטי לממשלה מייצג את המדינה בבית המשפט באמצעות מערך הייעוץ המשפטי לממשלה. הדבר עלול ליצור מתח כאשר הממשלה מבקשת להגן על עמדה שהיועץ המשפטי שלה סבור שאינה חוקית. תפקידו המוסדי של המשרד הוא להציג את עמדתה המשפטית של הממשלה ככל שהחוק מאפשר ולייצג את האינטרס הציבורי; נבחרי הציבור נותרים אחראים לבחירות המדיניות שלהם במסגרת החוק.
תביעה והליכים פליליים
פרקליטות המדינה מנהלת חלק ניכר מההליכים הפליליים מטעם המדינה. התובעים בוחנים את הראיות ואת האינטרס הציבורי כשהם מחליטים אם להגיש כתב אישום, ומציגים את התיקים בבית המשפט. תיאור ההליכים הפליליים של משרד המשפטים מסביר שהתביעה קובעת אם הראיות מבססות עבירה של אדם מסוים ואם העמדה לדין משרתת את האינטרס הציבורי.
שילוב הנהגת התביעה עם הייעוץ המשפטי לממשלה נועד להקנות למשרד תמונה רחבה של חובותיה המשפטיות של המדינה ולשמור על עצמאות מוסדית של החלטות התביעה מפני הכוונה פוליטית יומיומית. הסדר זה מעורר גם דיון על ריכוז סמכויות ועל אופן קבלת הייעוץ המשפטי בידי הממשלה. אלו שאלות של מבנה מוסדי; הן אינן פוטרות תובעים מחובותיהם לפי הדין הפלילי.
הצעות לשינוי מבנה המשרה
ב־2026 דנה הכנסת בהצעת חקיקה להפרדת תפקידי היועץ המשפטי לממשלה והתובע הכללי. דיווח הכנסת על הצעת החוק מתאר את ההצעה ואת אישורה בקריאה הראשונה; הודעה נפרדת של ועדה תיארה בהמשך הצעת חוק שהתקדמה לקריאות נוספות. אישור הצעת חוק בשלב אחד אינו משנה כשלעצמו את הדין: עליה להשלים את הליך החקיקה.
יש לבחון את כללי המינוי והכהונה המדויקים לפי הדין וההחלטות שבתוקף, משום שהוצעו שינויים בהם. ההבחנה המעשית העיקרית היא שהייעוץ המשפטי מנחה את פעולות הרשות המבצעת, ואילו תובעים מחליטים ומנהלים הליכים פליליים לפי אמות מידה משפטיות. ראו תפקידו של בג״ץ בביקורת ואת המסגרת החוקתית.